伊斯兰教传入吉林省已有三百多年的历史，是回族伴随着其它流民迁徙而来的，最先到吉林境内的是康熙初年“三藩之乱”后被流放的降服者。以后陆续过来一些逃荒与闯关东的流民。大多数来自于山东、河北、京津等地区。他们开荒自耕或流动经商，如在九台的蜂蜜营屯等“北五屯”、吉林乌拉城、双阳大营子村、长春等地安家落户，由于回族的宗教生活离不开清真寺，所以各地就陆续修建起了清真寺，伊斯兰教也就传进了吉林省。现吉林省有信仰伊斯兰教的群众13.8万多人，清真寺近90所。1981年成立了省伊斯兰教协会，1984年9月10日召开第二次代表会议，1988年10月4日召开第三次代表会议，2000年11月22日召开第四次代表会议，会址在长春市长通路清真寺内，现任第四届会长为杨清庭阿訇。